• Beck J, Bornemann-Kolatzki K, Knorr C, Taeubert H, Brenig B (2006) Molecular characterization and exclusion of porcine GUSB as a candidate gene for congenital hernia inguinalis/scrotalis. BMC Vet Res, 2(1): 14.
• Ding X, Zhang Q, Flury C, Simianer H (2006) Haplotype reconstruction and estimation of haplotype frequencies from nuclear families with only one parent available. HUM HERED, 62: 12-19.
• Flury C, Täubert H, Simianer H (2006) Extension of the concept of kinship, relationship, and inbreeding to account for linked epistatic complexes. LIVEST SCI, 103: 131-140.
• Flury C, Tietze M, Simianer H (2006) Epistatic kinship a new measure of genetic diversity for short-term phylogenetic structures theoretical investigations. J ANIM BREED GENET, 123: 159-171.
• Foulley JL, van SM, Alderson L, Amigues Y, Bagga , Mc BB, Cardellino R, Davoli R, Delgado JV, Fimland E, Gandini GC, Glodek P, Groenen MAM, Hammond K, Harlizius B, Heuven H, Joosten R, Martinez AM, Matassin D, Meyer JN, Peleman J, Ramos AM, Rattink AP, Russo V, Siggen KW, Vega-Pla JL, Olliver L (2006) Genetic Diversity Analysis Using Lowly Polymorphic Dominant Markers. Journal of Heredity (Online), 97: 244-252.
• Gianola D, Simianer H (2006) A Thurstonian model for quantiative genetic analysis of ranks. GENETICS, 174: 1-12.
• König S, Hübner G, Sharifi AR, Bohlsen E, Detterer J, Simianer H, Holtz W (2006) Beziehung zwischen dem somatischen Zellgehalt und dem Erstbesamungserfolg in Milchviehherden Ostfrieslands analysiert mit logistischen Modellen. ZUCHTUNGSKUNDE, 78: 89-101.
• König S, Köhn F, Kuwan K, Simianer H, Gauly M (2006) Use of repeated measures analysis for evaluation of genetic background of dairy cattle behaviour in automatic milking systems. J DAIRY SCI, 89: 3636-3644.
• König S, Simianer H (2006) Approaches to the management of inbreeding and relationship in the German Holstein dairy cattle population. LIVEST SCI, 103: 40-53.
• König S, Swalve HH (2006) Modellkalkulationen zu züchterischen Möglichkeiten auf Klauengesundheit beim Rind. ZUCHTUNGSKUNDE, 78: 345-356.
• König S, Swalve HH (2006) Züchterische Möglichkeiten zur Verbesserung der Klauengesundheit. DGfZ-Schriftenreihe, 43: 49-57.
• Lind B (2006) Ökonomische Gewichte für Merkmale des Gesamtzuchtwertes. DGfZ-Schriftenreihe, 43: 139-147.
• Pinent T, Simianer H, Weigend S (2006) Biodiversity within and between chicken populations. WORLD POULTRY SCI J, 62 Suppl.: 232.
• Reist-Marti SB, Abdulai A, Simianer H (2006) Optimum allocation of conservation funds and choice of conservation programs for a set of African cattle breeds. GENET SEL EVOL, 38: 99-126.
• SanCristobal M, Chevalet C, Haley CS, Joosten R, Rattink AP, Harlizius B, Groenen MAM, Amigues Y, Boscher MY, Russel G, Law A, Davoli R, Russo V, Désautés C, Alderson L, Fimland E, Bagga M, Delgado JV, Vega-Pla JL, Martinez AM, Ramos M, Glodek P, Meyer JN, Gandini GC, Matassino D, Plastow GS, Siggens KW, Laval G, Archibald AL, Milan D, Hammond K, Cardellino R (2006) Genetic diversity within and between European pig breeds using microsatellite markers. ANIM GENET, 37: 189-198.
• SanCristobal M, Chevalet C, Peleman J, Heuven H, Brugmans B, van SM, Joosten R, Rattink AP, Harlizius B, Groenen MAM, Amigues Y, Boscher MY, Russel G, Law A, Davoli R, Russo V, Dèsautes C, Alderson LFE, Bagga M, Delgado JV, Vega-Pla JL, Martinez AM, Ramos M, Glodek P, Meyer JN, Gandini G, Matassino D, Siggens K, Laval G, Archibald A, Milan D, Hammond K, Cardellino R, Haley C, Plastow G (2006) Genetic diversity in European pigs utilizing amplified fragment length polymorphism markers. ANIM GENET, 37: 232-238.
• Schwerin M, Fries R, Simianer H, Swalve H, Wimmers K (2006) Die strukturelle und funktionelle Genomanalyse - neue Wege zum Verstehen des Phänotyps - Stand und Perspektiven. ZUCHTUNGSKUNDE, 78: 1-16.
• Sharifi AR, Horst P, Simianer H, Valle-Zarate A (2006) The effect of frizzle gene and dwarf gene on reproductive performances of broiler breeder dams under high and normal ambient temperature. WORLD POULTRY SCI J, 62, Suppl.: 213.
• Simianer H, Weigend S, Rath D (2006) Strategische Ansätze zur Erhaltung und Nutzung genetischer Diversität innerhalb und zwischen Nutztierpopulationen. Agrarspectrum, 39: 33-50.
• Wimmers K, Schellander K, Simianer H, Fries R, Maak S, Thaller G (2006) HeDiPig - Entwicklung neuer molekulargenetischer Werkzeuge zur Prävention von Erbdefekten beim Schwein. GenomXPress, 3: 11-13.